隔離式生物潔凈室和一般生物潔凈室的不同點是，以防止微生物污染的外逸為目的，因此，它對自身的潔凈度并無要求,送風(fēng)不需要效率高的過濾器，但排風(fēng)必須經(jīng)一道甚至兩道高效過濾器才能排放，而且需要隔離。隔離式生物潔凈室也被叫做具有生物危險性的生物潔凈室或簡稱危險性生物潔凈室，如生物安全實驗室、負(fù)壓隔離病房。
一、生物危險度標(biāo)準(zhǔn)
隔離式生物潔凈室中的生物安全實驗室的等級由它所隔離的微生物的危險程度確定。國外一些研究機構(gòu)已經(jīng)有了自己獨立的危險度標(biāo)準(zhǔn)。
二、隔離方式
隔離的概念包括一次隔離和二次隔離。一次隔離是指工作人員和病原體的隔離，二次隔離是指實驗或工作區(qū)和外界的隔離。對于高的生物危險度級別，不僅需要采取一次隔離措施,還要采取二次隔離措施。目前國外采用的一次隔離方式主要是用生物安全柜或稱生物安全工作臺，它是阻止危險微生物外逸的一道屏障。 二次隔離則是將工作區(qū)變?yōu)樨?fù)壓區(qū)，人出入要通過空氣閘最好是緩沖室，物品的拿進拿出要通過高壓滅菌器等裝置。下圖就是這樣的隔離方式，被稱為生物安全實驗室。必須注意的是，隔離式生物潔凈室對人員更衣的要求，出來時比進入時更嚴(yán)格，不僅要換工作服，而且要經(jīng)過淋浴、干燥等處理，所有衣物必須先消毒再清洗。
   

三、生物安全柜
這是作為隔離式生物潔凈室的生物安全實驗室中進行第一次隔離的手段，類似于負(fù)壓潔凈工作臺，但要求更嚴(yán)。下表是國際上常有的三種規(guī)格。
   

下表是我國標(biāo)準(zhǔn)《生物安全柜》（JG 170-2005）對生物安全柜的分類分級

  

下圖是國產(chǎn)Ⅱ-A安全柜結(jié)構(gòu)之一。 
    

這里要指出的是，按照一般規(guī)定，如果安全柜內(nèi)有轉(zhuǎn)動機械，則當(dāng)轉(zhuǎn)動機械使用時，由于增加了柜內(nèi)污染外逸的可能性，所以在此期間內(nèi)室內(nèi)不允許進行其它操作。當(dāng)安全柜內(nèi)操作完畢后，不允許立即停止其運行，而是要繼續(xù)運行幾分鐘再進行停止。
四、生物安全實驗室分級
WHO制定的實驗室類型與危險類別
  

2004年我國國家標(biāo)準(zhǔn)《實驗室生物安全通用要求》（GB19489-2004）和《生物安全實驗室建筑技術(shù)規(guī)范》（GB50346-2004）將我國生物安全實驗室的分級和國際接軌，從低到高分為1～4級；GB50346的2011年修訂后又將生物安全實驗室分為三類。
以BSL-1、BSL-2、BSL-3、BSL-4表示相應(yīng)級別的生物安全實驗室；以ABSL-1、ABSL-2、ABSL-3、ABSL-4表示相應(yīng)級別的動物生物安全實驗室。
生物安全實驗室分級   
      

生物安全實驗室分類  
      

我國的三級、四級生物安全實驗室有潔凈度級別要求，送風(fēng)末級過濾器要求高效過濾器。
五、負(fù)壓隔離病房
作為隔離式生物潔凈室的一個重要應(yīng)用對象，負(fù)壓隔離病房自SARS以來，受到極大關(guān)注，給與它的設(shè)計理念是以高負(fù)壓、密封門、全新風(fēng)為代表。被稱為“靜態(tài)隔離"的這種原理，既效果差，又耗能大，十分昂貴，不利推廣。
而現(xiàn)在提出負(fù)壓隔離病房的新原理是"動態(tài)隔離"，用低負(fù)壓（-5Pa）代替高負(fù)壓，用負(fù)壓潔凈室的緩沖室和普通非木門代替密封門，用雙送風(fēng)口、循環(huán)風(fēng)和動態(tài)氣流密封負(fù)壓高效排風(fēng)裝置代替全新風(fēng)。
按照5Pa壓力梯度規(guī)劃的負(fù)壓隔離病區(qū)壓力分布見下圖。
             

因病房及其衛(wèi)生間都是污染區(qū)，而衛(wèi)生間都設(shè)有排風(fēng)，氣流必是由病房流向衛(wèi)生間的。從動態(tài)氣流隔離的原理出發(fā)，不提病房對衛(wèi)生間的壓差值，而只要求從病房向衛(wèi)生間的定向氣流，即衛(wèi)生間通過調(diào)排風(fēng)，使其負(fù)壓程度稍高于病房即可，這可將衛(wèi)生間門上做上百葉。
負(fù)壓隔離病房沒有潔凈度級別要求，送風(fēng)有中效以上過濾器就可以了，但排風(fēng)為了其一部分能自循環(huán)使用，一部門能無害排出，必須用高效過濾器。